Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c2Q8BL74 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms