Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms