Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Dsg1bQ7TSF1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms