Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms