Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tgfbr2Q62312 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tgfbr2Q62312 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tgfbr2Q62312 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Tgfbr2Q62312 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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