Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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AtrxQ61687 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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AtrxQ61687 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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AtrxQ61687 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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AtrxQ61687 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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AtrxQ61687 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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AtrxQ61687 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtrxQ61687 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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