Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Tnfrsf8Q60846 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms