Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 444.4 ms