Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Fam208bQ5DTT3 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Fam208bQ5DTT3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Fam208bQ5DTT3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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