Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms