Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC8.27□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms