Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q3U6N9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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