Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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Usp39Q3TIX9 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Usp39Q3TIX9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Usp39Q3TIX9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Usp39Q3TIX9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Usp39Q3TIX9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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