Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms