Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms