Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc21bQ0HA38 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc21bQ0HA38 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc21bQ0HA38 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc21bQ0HA38 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms