Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms