Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms