Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Taf1bP97358 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Taf1bP97358 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Taf1bP97358 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Taf1bP97358 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Taf1bP97358 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Taf1bP97358 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Taf1bP97358 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Taf1bP97358 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Taf1bP97358 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Taf1bP97358 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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