Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H3f3aP84244 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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