Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NfybP63139 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NfybP63139 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NfybP63139 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NfybP63139 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NfybP63139 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NfybP63139 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NfybP63139 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NfybP63139 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NfybP63139 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 654.5 ms