Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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