Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb4P54761 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms