Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StomP54116 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StomP54116 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms