Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TgfaP48030 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms