Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ItgavP43406 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ItgavP43406 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ItgavP43406 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ItgavP43406 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ItgavP43406 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ItgavP43406 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ItgavP43406 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ItgavP43406 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ItgavP43406 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ItgavP43406 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ItgavP43406 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms