Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc3P33622 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms