Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc5P32043 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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