Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms