Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18526 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18526 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18526 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms