Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ccl20O89093 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl20O89093 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ccl20O89093 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
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Ccl20O89093 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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