Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp4O70480 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms