Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1aO35134 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms