Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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