Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5458L7N219 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5458L7N219 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5458L7N219 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5458L7N219 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5458L7N219 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5458L7N219 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms