Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms