Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn20G5E8X0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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