Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf148G3X9R7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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