Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm29188-201ENSMUST00000191173 767 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms