Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx60E9PZQ1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms