Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms