Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms