Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PtprsB0V2N1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PtprsB0V2N1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PtprsB0V2N1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PtprsB0V2N1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprsB0V2N1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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PtprsB0V2N1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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PtprsB0V2N1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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