Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lcn6A2AJB9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lcn6A2AJB9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Lcn6A2AJB9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lcn6A2AJB9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lcn6A2AJB9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lcn6A2AJB9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Lcn6A2AJB9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Lcn6A2AJB9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Lcn6A2AJB9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lcn6A2AJB9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Lcn6A2AJB9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Lcn6A2AJB9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Lcn6A2AJB9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lcn6A2AJB9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lcn6A2AJB9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Lcn6A2AJB9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lcn6A2AJB9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Lcn6A2AJB9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Lcn6A2AJB9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Lcn6A2AJB9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lcn6A2AJB9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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