Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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