Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms