Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms