Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 AC093159.2-201ENST00000603429 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AC119674.1-221ENST00000641594 1213 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 ZNF160-201ENST00000355147 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 APOL1-203ENST00000397279 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AC009927.1-201ENST00000510501 1779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 REG1B-201ENST00000305089 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 LINC00619-201ENST00000374432 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 FAM83A-AS1-201ENST00000517519 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 LINC02413-202ENST00000552353 898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AC239585.2-202ENST00000624629 434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AL356488.3-201ENST00000608574 2888 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSUH2Q9Y2M2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSUH2Q9Y2M2 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms