Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms