Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms